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Este estudo utiliza modelagem baseada em agentes no software NetLogo, integrada a dados histológicos, para simular a progressão da fibrose pulmonar idiopática e avaliar a eficácia de tratamentos com pirfenidona e pentoxifilina, isolados ou combinados, visando aprimorar a compreensão da doença e apoiar decisões terapêuticas.
Este estudo demonstra que os quimiotipos, derivados da espectroscopia FTIR e análise de machine learning em *Drosophila melanogaster*, funcionam como proxies integradores que preveem com sucesso a variação genotípica, fisiológica e a resposta ao estresse em diferentes populações.
Este estudo estabelece um quadro padronizado de procedimentos operacionais para proteômica em carne cultivada, demonstrando que a otimização de protocolos de preparação de amostras e a aquisição de dados independente (DIA) superam as variações técnicas atuais, permitindo uma caracterização molecular robusta e comparável essencial para o desenvolvimento e a regulamentação do setor.
O artigo apresenta a plataforma BARMIX, que combina experimentos multiplexados com células cancerígenas de marcação de DNA e uma estrutura probabilística para quantificar de forma eficiente e precisa a resistência a tratamentos em populações celulares heterogêneas de tumores do estroma gastrointestinal (GIST), permitindo o desenvolvimento de terapias personalizadas.
Este artigo apresenta métodos numéricos para identificar bandas de ressonância em motores de voo de insetos com elasticidade distribuída, revelando que tal característica morfológica, embora de risco moderado, oferece alto retorno ao expandir significativamente a faixa de estados cinemáticos eficientes quando bem ajustada.
Este estudo apresenta o primeiro modelo metabólico de escala genômica baseado no pangenoma de *Xylella fastidiosa*, que não apenas guia a formulação de meios de cultura definidos e revela uma nova via metabólica para o uso de acetato, mas também identifica e valida experimentalmente a produção de poliaminas como um potencial fator de virulência do patógeno.
O artigo apresenta o GlycoDiveR, um framework modular em R de código aberto projetado para simplificar a análise, visualização e exploração de dados de glicoproteômica de alta dimensionalidade, superando as limitações das ferramentas existentes ao oferecer uma arquitetura flexível e acessível que não requer programação avançada.
Este estudo integra sequenciamento genômico e perfis imunológicos longitudinais em 101 indivíduos saudáveis para definir três imunotipos distintos com assinaturas metabólicas e inflamatórias específicas, além de revelar associações genéticas que influenciam a heterogeneidade imunológica basal.
Este estudo demonstra que o framework computacional TransComp-R melhora a utilidade de modelos murinos para a descoberta de tratamentos de Alzheimer de início tardio, identificando e validando prospectivamente que o antagonista de receptores de orexina, suvorexant, reduz os níveis de tau fosforilada em humanos.
Este estudo demonstra, por meio de modelagem computacional e análise de dados genômicos, que a deriva do sistema de desenvolvimento é um fenômeno pervasivo na evolução do desenvolvimento do meristema vegetal, onde a expressão gênica conservada é mantida apesar de uma reorganização contínua e neutra das redes regulatórias e das sequências não codificantes.
Este estudo integra modelagem metabólica e metabolômica para demonstrar que, embora o microbioma do ficosfera de *Microcystis* expanda o repertório metabólico funcional e apresente redundância, os perfis metabólicos são majoritariamente impulsionados pelas saídas metabólicas das cianobactérias, revelando interações bioquímicas cruciais para a dinâmica dos blooms.
Este estudo utiliza um modelo matemático para demonstrar que os polifosfatos liberados pelas plaquetas aceleram a geração de trombina em coagulação iniciada por fator tecidual sob fluxo, reduzindo o limiar de densidade de fator tecidual necessário para o surgimento do coágulo e diminuindo a sensibilidade do processo à inibição pelo inibidor da via do fator tecidual (TFPI), principalmente através da aceleração da conversão de FV em FVa.
O artigo apresenta o FASTERCC, uma nova versão do algoritmo FASTCC que acelera drasticamente o teste de consistência de fluxo e a reconstrução de redes metabólicas de grande escala ao utilizar informações estruturais para pré-processamento, reduzindo o tempo de execução em até 20 vezes e otimizando análises subsequentes.
Este estudo identificou assinaturas moleculares circulantes combinadas de miRNAs e proteínas que demonstram alta capacidade preditiva para estratificar o risco e diferenciar os desfechos clínicos em crianças com cardiomiopatia dilatada.
O artigo apresenta o X-Cell, um modelo de linguagem difusivo escalável treinado no maior compêndio de transcriptomas de perturbação genética (X-Atlas/Pisces) até a data, que supera os métodos existentes na previsão de respostas celulares a perturbações em diversos contextos biológicos e demonstra generalização zero-shot e leis de escala semelhantes às dos grandes modelos de linguagem.
Este estudo utiliza simulações de controle ótimo estocástico em um modelo humano detalhado para demonstrar que, embora o ruído sensorimotor influencie pouco a cinemática média, ele molda a variabilidade do movimento e o esforço esperado, revelando que a minimização do esforço subjaz à prioridade do sistema de controle em limitar a variabilidade do centro de massa e da altura do pé em detrimento da variabilidade articular.
Este estudo apresenta um modelo computacional de prova de conceito que integra simulações de interação fluido-estrutura com biologia de sistemas para capturar a dinâmica multiescala da calcificação da válvula aórtica, demonstrando como o acoplamento entre forças hemodinâmicas e vias de sinalização bioquímica pode prever a progressão da doença.
Este estudo apresenta um modelo computacional que demonstra como a adaptação de tumores ao microambiente ósseo altera sua dependência de fatores de crescimento derivados do osso, tornando as células adaptadas menos responsivas à inibição da reabsorção óssea em comparação com as células não adaptadas.
Este estudo longitudinal em camundongos demonstra que dietas ricas em gorduras com diferentes fontes provocam reprogramação multi-ômica persistente no eixo hospedeiro-microbioma, onde a composição microbiana basal influencia a remodelação e uma "memória" de alterações específicas, como a supressão de genes MHC-II e mudanças na abundância de certas bactérias, permanece mesmo após a reversão para uma dieta controle.
Este trabalho apresenta o modelo BIRDkiss, uma ferramenta de código aberto que integra orçamentos de energia simplificados e toxicocinética/toxicodinâmica para prever o impacto de pesticidas, isolos ou em mistura, na reprodução de aves sob diferentes cenários de disponibilidade alimentar, visando aprimorar a avaliação de riscos ambientais.